Toxoplasma gondii 529 baz çifti büyüklüğünde tekrar bölgesine (RE) özgü hızlı döngü aracılı izotermal amplifikasyon testinin geliştirilmesi ve analitik hassasiyetinin belirlenmesi
Makaleler > Tam Makale · 2021
Yazarlar: Muhammet KARAKAVUK, Hüseyin CAN, Tuğba KARAKAVUK, Ceren GÜL, Sedef ERKUNT, Aytül GÜL, Aysu DEĞİRMENCİ DÖŞKAYA, Cemal ÜN, Adnan Yüksel GÜRÜZ, Mert DÖŞKAYA
Ege Tıp Dergisi, Uluslararası, 2021, cilt 60, ss 269-273
DOI: 10.19161/etd.860099
Özet
Amaç: Toxoplasma gondii insan ve sıcakkanlı hayvanlarda hastalıklara neden olan bir protozoondur. Bu çalışmanın amacı toksoplazmozis tanısı için T. gondii tekrar bölgesine (RE) özgü primerlerin tasarlanması ile geliştirilen floresans esaslı hızlı Döngü Aracılı İzotermal Amplifikasyon (LAMP) testinin analitik hassasiyetini belirlemektir. Gereç ve Yöntem: Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile elde edilen T. gondii RE, pCR2.1-TOPO vektörüne klonlanmıştır. Spesifik primerler kullanılarak geliştirilen LAMP testinin analitik hassasiyeti pCR2.1-RE vektörünün seri seyreltmeleri ile belirlenmiştir. Bulgular: T. gondii RE genine özgü tasarlanan primerler ile geliştirilen LAMP testinin analitik hassasiyetinin ≤10 plazmit/reaksiyon olduğu tespit edilmiştir. Sonuç: RE bölgesi T. gondii geni içinde 200-300 kere tekrar ettiğinden dolayı geliştirilen testin 0,05 takizoit/reaksiyon saptama limitine sahip olduğu hesaplanmıştır. LAMP testinin kolay, ucuz, hızlı ve saha koşullarına uygun olması ve diğer moleküler testlerden daha hassas olması nedeniyle umut verici olduğu öngörülmektedir