PNEUMOCYSTİS JİROVECİİ TANISI İÇİN HIZLI KOLORİMETRİK LAMP TESTİNİN GELİŞTİRİLMESİ VE ANALİTİK DUYARLILIĞIN BELİRLENMESİ
Bildiriler > Özet Bildiri · 2024
Yazarlar: Muhammet KARAKAVUK, Tuğba Karakavuk, Hüseyin CAN, Mervenur Güvendi, Seren Kaplan, Ceren Gül, İrem Yavuz, Aysu DEĞİRMENCİ DÖŞKAYA, Gizem Mutlu, Adnan Yüksel GÜRÜZ, Cemal ÜN, Mert DÖŞKAYA
Ege Herkes için Sağlık Kongresi, Türkiye, İzmir, Ulusal, Sözlü Sunum, Özet Bildiri, 2024-2024, ss 42-42
Özet
<p>Giriş ve Amaç: Pneumocystis jirovecii, özellikle bağışıklık sistemi baskılanmış bireyleri etkileyen</p><p>Pneumocystis pnömonisine (PcP) neden olan tek hücreli ökaryotik bir mantardır. Polimeraz zincir</p><p>reaksiyonu (PCR), yayma preparatları ve immünofloresan boyama gibi mevcut tanı yöntemleri</p><p>genellikle pahalıdır ve özel laboratuvar ekipmanı ve uzmanlık gerektirir. Bu nedenle hızlı, güvenilir,</p><p>uygun maliyetli ve saha koşullarında kullanılabilecek alternatif tanı yöntemlerine ihtiyaç vardır. Bu</p><p>çalışmada, P. jirovecii teşhisi için yüksek hassasiyet ve özgüllüğü ile bilinen hızlı bir genetik</p><p>amplifikasyon tekniği olan Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) testinin geliştirilmesi</p><p>amaçlanmıştır.</p><p>Yöntem ve Bulgular: PrimerExplorer V5 yazılımı kullanılarak P. jirovecii'nin MSG, 18S rRNA geni (iki</p><p>primer seti) bölgelerini hedefleyen spesifik LAMP primer setleri tasarlanmıştır. Pozitif kontrol</p><p>plazmidleri oluşturmak için, P. jirovecii'nin 18S rRNA ve MSG genleri laboratuvarlarımızdaki P. jirovecii</p><p>pozitif örnekleri kullanılarak PCR ile çoğaltıldı ve pozitif PCR ürünleri pCR2.1 TOPO vektörüne klonlandı.</p><p>LAMP testlerinin analitik duyarlılığını değerlendirmek için pozitif kontrol plazmidleri distile su ile</p><p>seyreltilerek 106-105-104-103-102-10-1-10-1 plazmid kopyası/reaksiyon içeren pozitif kontroller elde</p><p>edilmiştir. Sonuçlara göre, “Hızlı Kolorimetrik PcP LAMP testi” nin analitik duyarlılığı 1 kopya</p><p>plazmid/reaksiyon olmuştur.</p><p>Sonuç: Bu çalışmada geliştirilen “Hızlı Kolorimetrik PcP LAMP testi” temel laboratuvarlarda ve/veya</p><p>sahada uygulanabilmesi, deneyimli personel gerektirmemesi, yüksek duyarlılığa sahip olması ve testin</p><p>değerlendirilmesinin herhangi bir cihaz kullanılmadan çıplak gözle yapılabilmesi nedeniyle solunum</p><p>sistemi örneklerinde P. jirovecii tanısında önemli avantajlar sağlayacaktır.Anahtar</p><p>Teşekkür: Bu çalışma TÜSEB tarafından ADD'ye verilen proje (Proje No: 24479) ile desteklenmiştir.</p><p>Anahtar Kelimeler: Pneumocystis jirovecii, LAMP, Tanı, MSG, 18SrRNA</p>