Füzyon genlerinin prostat kanseri olgularında yaygınlıklarının araştırılması ve klinikle ilişkilerinin belirlenmesi
Proje no. 20263 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2018
Özet
Prostat kanseri dünya çapında erkeklerde en sık görülen, yüksek morbidite ve mortaliteyle ilişkili yaygın bir hastalıktır. Prostat kanseri örnekleriyle gerçekleştirilen geniş çaplı transkripsiyonel ve proteomik profilleme çalışmalarına rağmen, hastalık progresyonuyla ilişkili potansiyel genetik değişimler ve moleküler biyolojik yolaklardaki değişiklikler hakkındaki bilgilerimiz sınırlıdır. Güncel çalışmalar, füzyon genlerin prostat kanseri gelişiminde önemli olduklarını ortaya koymuştur. Özellikle ERG onkogeni, hormona dirençli prostat kanseri hastalarında bulunan TMPRSS2-ERG hibrid geni oluşturmak üzere, TMPRSS2 geniyle füzyon olur. ERG’nin aşırı ekspresyonuyla sonuçlanan bu füzyon, androjen reseptörü ekspresyonunu etkileyerek bu yolla prostat kanserinin gelişimine neden olur. Bu çalışmada, radikal prostatektomi olan 58 olgunun ameliyat öncesi idrar ve sonrası parafine gömülü prostat dokusu örneklerinden, prostat kanserinde yaygın görülen C15ORF217-ETV1, CANT1-ETV4, DDX5-ETV4, FLJ35294-ETV1, HERV-ETV1, HNRPA2B1-ETV1, SLC45A3-ETV1, SLC45A3-ETV5, TMPRSS2-ERG, TMPRSS2-ETV1, TMPRSS2-ETV4 ve TMPRSS2-ETV5 olmak üzere toplam 12 adet füzyon genin transkriptine özgü yeni bir RT-PCR array yöntemi geliştirilmiştir. Oluşan amplikonlar PCR sonrası agaroz jel elektroforezi yöntemiyle de doğrulanmıştır. Prostat kanserinde en sık gözlenen füzyon gen TMPRSS2-ERG olmasına karşılık, çalışmamızda 27 olgunun idrar (n = 58) ve 13 olgunun doku (n = 53) örneğinde, sırasıyla % 46.5 ve % 24.5 oranlarıyla, HNRPA2B1-ETV1 füzyon geni olmuştur. HNRPA2B1-ETV1 füzyon geni idrar örneğinde, doku örneğine kıyasla, daha yüksek hassasiyetle saptanabilmiştir. Ayrıca, diğer olguların idrar ve doku örneklerinde TMPRSS2-ERG, SLC45A3-ETV5, SLC45A3-ETV1, FLJ35294-ETV1 ve DDX-ETV4 füzyon genleri saptanmıştır. Sonuç olarak, 12 farklı füzyon genin eş zamanlı tayini için geliştirilen hızlı, ucuz ve yüksek hassasiyetli RT-PCR array yönteminin prostat kanseri tanı ve takibinde kullanılabileceğini; özellikle kolay ve non-invaziv yolla elde edilebilen idrar örneklerinde daha hassas sonuçlar alınabileceği gösterilmiştir.