Arabidopsis thaliana'nın endoplazmik retikulum stresine verdiği yanıtta CLE peptidlerinin rolünün araştırılması
Proje no. 20741 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2019
Özet
Endoplazmik retikulum (ER), hücrede salgı proteinlerinin katlandığı ana organeldir. Stres koşullarında yanlış katlanan proteinler ve katlanmamış proteinlerin ER’ de birikimi hücre dengesini bozar ve bu durum “ER stresi” olarak adlandırılır. Hücrede ER stresinin şiddetine bağlı olarak çeşitli sinyal yolakları aktifleşmektedir. Bu yolaklar: katlanmamış protein yanıtı, ER ilişkili protein parçalanması, ve ER kaynaklı hücre ölümü olarak kabaca üçe ayrılmaktadır.<br /> CLV3/EMBRYO SURROUNDING REGION-RELATED (CLE) familyası genlerinin, kısa salgı peptidleri kodladığı ve bitki gelişimini düzenleyen reseptör benzeri kinaz ligandları olarak işlev gördüğü bilinmektedir. CLE sınıfı sinyal peptidleri gelişimsel düzenlemeden,çevresel yanıtların koordinesine kadar değişen çeşitli rollere sahip peptidlerdir. Ayrıca, CLE gen ailesi sürgün ve çiçek meristemlerinde kök hücre aktivitesinin sürdürülmesinde negatif geri bildirimin ana bileşendir.<br /> ER stresi ve katlanmamış proteine yanıt sinyalinin hücrede redoks sinyallemesi gibi farklı yolakları uyardığı yeni çalışmalarla ortaya konmuştur.<br /> Çalışmanın amacı, model bitki <em>Arabidopsis thaliana</em>’ da endoplazmik retikulum stresi altında CLE ailesi genlerinin kodladığı kısa salgı peptidlerinin rollerinin ortaya konmasıdır. Bu mekanizmaların aydınlatılması ile CLE peptidlerinin ER stresi ile ilişkisi ilk defa ortaya konmuş olacaktır. Bu amaca uygun olarak ER stresini uyarıcı ajan olan tunikamisin uygulanan <em>A. thaliana</em> bitkilerinde<em> CLE19, CLE17, CLV3, WUS, CLE40, CLV2, CLE25, CLE5, CLE6</em> genlerinin ifadeleri qRT-PCR ile belirlenip, CLE metabolizmasının transkripsiyon seviyesindeki düzenlenmesi belirlenecektir.