Denizel bir süngerden Axinella sp izole edilen Aspergillus MF44 suşunun yeni bir tür olarak Aspergillus marinensis nov tanımlanması.
Proje no. 23669 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2022
Özet
Aspergillus türleri sahip oldukları metabolik kapasiteleri ve aktif biyomolekülleri nedeniyle yeni enzim ve antimikrobiyal maddelerin keşfi için uzun süredir doğal kaynaklar olarak kullanılmaktadır. Araştırmalar karasal kaynaklı fungusların büyük ölçüde çalışılmasından dolayı denizel funguslar gibi keşfedilmemiş yeni kaynaklara yönelmiştir. Bu kapsamda tamamlanmış olan 109S361 No’lu TÜBİTAK projesinde Türkiye’deki farklı denizel lokasyonlardan 48 sediment ve 78 sünger örneğinden toplam 118 deniz kaynaklı fungus suşu izole edilmiş ve polifazik yaklaşımla tanımlanmıştır. Bu izolatlardan Büyükeceli, Gülnar, Mersin kıyılarından çıkarılan Axinella sp. süngerinden izole edilen MF44 kodlu suş ise özgün fenotipik karakteristikler göstermiş ve NCBI’da ITS dizisi bakımından Aspergillus sp. ile %97 ?den daha düşük oranda homoloji göstermiştir. Eldeki fenotipik ve genotipik bulgular MF 44 nolu suş izolatlarının yeni bir Aspergillus türü olduğunu işaret etmektedir. Bu amaçla MF44 kodlu suşunun yeni bir Aspergillus türü olarak tanımlanabilmesi için fenotipik, biyokimyasal ve genotipik karakterizasyonunun tamamlanması amaçlanmıştır. Bunun için MF 44 No’lu suş %2,5 deniz tuzu içeren ortamda aktifleştirilecektir. Ekstrolit profili LC–MS yöntemiyle belirlenecektir. Genotipik tanımlamada ise, tüm genom yeni nesil dizi analizi yöntemi ile dizilenecektir. Biyoinformatik analizler sonucunda genomda kalmodulin (CaM), β-tubulin (BenA) ve RPB2 gen bölgeleri çıkartılarak GenBank erişim numaraları alınacaktır. MF44 no’lu suşun CCF kültür koleksiyonuna kaydı yapılmış olup, CCF 6586 erişim numarası ile saklanmaktadır. Ayrıca NRRL veya CBS kültür koleksiyonlarından birine daha başvurularak tür tanılaması yapılan Aspergillus türünün tip türler altında saklanması sağlanacaktır.<br /> Sonuç olarak ülkemiz sularından izole edilen denizel MF44 suşu yeni bir Aspergillus türü olarak tanımlanacak (Aspergillus marinensis nov.) ve hem ülkemiz hem de dünya biyoçeşitliliğine katkı sağlanacaktır. Ayrıca hem denizel olması hem de daha önce keşfedilmemiş yeni bir Aspergillus türü olması nedeniyle biyoaktif yeni moleküllerin keşfini amaçlayan yeni projelere kaynak oluşturması amaçlanmaktadır.