İZMİR İLİ İLÇELERİNİN TARIM ARAZİLERİNDEN ALINAN TOPRAK ÖRNEKLERİNDEN İZOLE EDİLEN RHİZOPUS GENUSU ÜYELERİNDE RHİZOXİN ÜRETİCİSİ ENDOFUNGAL BAKTERİLERİN VARLIĞININ ARAŞTIRILMASI
Proje no. 560 · Durum: Kapanmış · 2017
Özet
Çalışmamızda tarımsal üretim faaliyetlerinin yoğun ve verimin her zaman oldukça yüksek olduğu İzmir ili ilçelerinin tarım topraklarından, bu bölgede de özellikle bitki patojeni olarak sık rastlanan Rhizopus türlerinden anti-mitotik aktivitesi olan rhizoxin üreticisi endofungal bakterilerin izolasyonu yapılmıştır. Yapmış olduğumuz çalışmada 237 farklı tarım arazisinden aldığımız toprak örneklerinden 237 adet Rhizopus spp. izole edilmişir. Rhizopus türleri fenotipik olarak tanılanmıştır. Fenotipik tanı aynı zamanda iki faklı gen bölgesini hedef alan iki farklı primer setinin kullanıldığı moleküler çalışmalar ile doğrulanmıştır. 237 adet Rhizopus spp’ ye ait izolatımızın hepsinde endofungal bakteri varlığı araştırılmıştır. 20 adet Rhizopus spp’ den endofungal bakteri izole edilmiştir. Bakteriler yine 2 farklı primer seti ile moleküler olarak tanılanmıştır. Buna göre; Alcaligenes faecalis (11 adet), Bacillus circulans (1 adet), Bacillus thuringiensis (3 adet), Bacillus cereus (1 adet), Klebsiella pneumoniae (2 adet), Leucobacter aridicolis (1 adet) ve Serratia marcescens (1 adet) türleri endofungal olarak izole edilmiştir. Alcaligenes faecalis, Bacillus circulans, Bacillus thuringiensis, Bacillus cereus ve Leucobacter aridicolis türlerinin ilk kez endofungal olarak izolasyonları yapılmıştır. Çalışmamız endofungal bakteri çeşitliliğine katkıda bulunmuştur. Çalışmamızda Alcaligenes faecalis (B 88, B93 kodlu ve B180 kodlu izolatlar), Bacillus cereus (B67 kodlu izolat), Bacillus thuringiensis (B40, B99 ve B152 kodlu izolatlar) türlerinde ketosentaz geninin varlığı tesbit edilmiştir. Ketosentaz geni saptanan bakteriyel izolatlarımız rhizoxin üretimi ayırma- saflaştırma, spektroskopik analiz ile araştırılmış ve B180 kodlu ve Alcaligenes faecalis olarak tanıladığımız türde rhizoxin saptanmıştır. Çalışmamız Burkholderia rhizoxinica haricinde bir türde (Alcaligenes faecalis) rhizoxin üretimini gösteren ilk çalışma olması açısından önem arz etmektedir.