BİYOLOJİK SİSTEMLERDE SCHİFF BAZLARININ MODEL SİSTEMLER ÜZERİNDE HESAPSAL YÖNTEMLERLE İNCELENMES
Proje no. 1221 · Durum: Kapanmış · 2016
Özet
Bu tezde biyolojik model sistemlerde lizin ve bazı isatin türevlerinin Schiff bazı oluşum mekanizmalarının hesapsal yöntemlerle incelenmesi amaçlanmıştır. Muhtemel yüklü ve kanonik lizin yapıları ile literatürdeki bilgiler ile belirlenen isatin türevlerinin detaylı konformasyonel analizi yapılmıştır. Konformasyonel analizden elde edilen konformerler B3LYP/cc-PVTZ ve ?B97XD/cc-PVTZ seviyelerinde tamamen optimize edilmiş ve frekans analizinin öznesi olmuşlardır. Bu optimize olan lizin ve isatin yapıları, yukarıda belirtilen seviyelerde, Schiff bazı oluşum reaksiyon mekanizması önermek için kullanılmıştır. Lizin-isatin Schiff bazı oluşum reaksiyon mekanizmasının potansiyel enerji yüzeyindeki reaksiyon koordinatları, farklı optimizasyon prosedürleri kullanılarak elektronik enerji, dipol moment, harmonik titreşim frekansları hesaplanmıştır. Sonuç olarak, fizyolojik koşullarda ve nötral reaksiyon koşulları için, biyolojik modellerde lizin ve imin bağının önem arzettiği, basamaklı bir mekanizma önerisi yapılmıştır.