QQ (Quorum Quenching) bakterilerde N- acyl homoserine lactonase aktivitesinin in silico ve in vitro analizi
Proje no. 24187 · Durum: Kapanmış · 2022
Özet
<p>Hücre-hücre etkileşimi ile popülasyon yoğunluğuna bağlı iletişim mekanizması çevreyi algılama sistemi (Quorum Sensing) olarak adlandırılmaktadır ve pek çok bakteri türünde görülmektedir. Quorum Sensing (QS) regülasyonu, bakterilerin popülasyon yoğunluklarına yanıt olarak gen ekspresyonlarını kontrol etmelerini sağlar. Bakteriler, üretim seviyeleri çevreden de etkilenebilse de, büyümenin belirli aşamalarında biriken sinyal molekülleri üretir. Bir eşik konsantrasyonunda (genellikle 10^11 cfu/ml ) sinyaller, hedef genleri indükleyebilen veya baskılayabilen bir regülatörü aktive eder. Bakteriler önemli enfeksiyon hastalıkların kaynağı olan virülans faktörlerini (çeşitli enzimler, ekzotoksinler, endotoksinler, antimikrobiyal direnç) bu sistem aracılığı ile sentezlemektedir. Belirli bir popülasyon yoğunluğuna ulaşan mikroorganizmalar antimikrobiyallere karşıda planktonik bakterilere göre yüksek direnç gücüne sahiptir. Bakterilerde çok fazla sinyal molekülü tanımlanmış olup Gram negatif bakterilerde yaygın olarak açil homoserin lakton (AHL) adı verilen sinyal molekülleri kullanılmaktadır. QS sisteminin virülans faktörlerinin regülâsyonundan sorumlu olmasının keşfinden sonra bu sistemin inhibisyonunu sağlamak antimikrobiyal direnç ile mücadelede yeni tedavi stratejileri olarak düşünülmektedir. QS inhibisyonu için Gram negatif bakterilerin kullandığı sinyal molekülü olan n-açil homoserin lakton’un yıkılması alternatif bir stratejidir. Böyle bir strateji bakterilerin arasındaki haberleşmeyi keseceğinden onları antimikrobiyallere karşı daha duyarlı hale getirecektir. Bu çalışmada doğal kaynaklardan izole edilmiş ve tanılanmış AHL degrede eden bakterilerin AHL parçalama aktiviteleri in vitro ve in silico teknikler ile araştırılacaktır. In vitro koşullarda violacein pigment inhibisyonu ve Gram negatif bakterilerde biyofilm oluşumunun engellenmesi parametreleri değerlendirilecektir. Ardından bir biyokontrol maddesi veya bir anti-patojenik ilaç adayı olarak yeni laktonazların karakterizasyonlarının yapılması hedeflenmiştir. </p>