Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanserli Olguların EGFR, FGFR2, PIK3CA, PTEN, SMAD4, STK11 ve TP53 Genlerinin Ekspresyon Seviyelerinin Ekshale Soluk Kondensat Örneklerinde Belirlenmesi
Proje no. 23878 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2023
Özet
Akciğer kanseri (AK), dünya çapında en sık görülen kanser türü olmasının yanında kansere bağlı ölüm nedenleri arasında da ilk sıradadır. AK, %10-15’ini küçük hücreli akciğer kanseri (KHAK) ve %85-90’ını ise küçük hücreli dışı akciğer kanserinin (KHDAK) oluşturduğu iki ana sınıfa ayrılır. Ortalama 5 yıllık AK sağkalım oranı tanı anında hastalığın evresine bağlı olarak değişmektedir. AK’nin tanı ve takip süreçlerinde, hastalığın gerçek zamanlı ve kolaylıkla tekrarlanabilir moleküler yapısının saptanması, genetik heterojenitesini gösterebilmesi için non-invaziv analiz yöntemlerine gereksinim duyulmaktadır. Non-invaziv bir yöntem olan ve hava yollarından gelen havanın soğutularak yoğunlaştırılasıyla oluşan ekshale soluk kondensatı (EBC); genomik, transkriptomik, epigenomik, proteomik ve metabolomik açıdan analiz imkanı sunmaktadır. Daha önceki projemizden elde ettiğimiz bulgulara göre; EBC örneklerinden elde edilen genomik profilin, ilgili tümör doku örneklerinin moleküler profilini yansıttığını saptadık. Çalışmamızda EBC’den cfRNA elde edilmesine volatil biyopsi, kandan cfRNA elde edilmesi likit biyopsi olarak tanımlanmıştır. En sık mutasyon saptanan genlerden yola çıkarak seçtiğimiz EGFR, FGFR2, PIK3CA, PTEN, SMAD4, STK11 ve TP53 genlerinin RT-qPCR yöntemiyle volatil biyopsideki ekspresyon seviyelerini belirleyeceğimiz bu çalışmada; AK’nin tanı ve takibinde EBC’nin geçerli bir biyomedya olacağını ve likit biyopsiden elde edilen verilerle korelasyon göstereceğini öngörmekteyiz.