İzmir İli Domates ve Biber Yetiştiriciliğinde Sorun Olan Cucumber mosaic virus CMV ve Tomato spotted wilt virus TSWV Etmenlerinin Yaygınlığının Belirlenmesi Ve Bu Etmenlerin Moleküler Karakterizasyonu
Proje no. 20475 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2019
Özet
Bu çalışmada İzmir ili Ödemiş, Bayındır, Torbalı, Menderes ve Tire ilçelerinde üretimi yapılan domates ve biber bitkilerinde enfeksiyona neden olan Cucumber mosaic virus ve Tomato spotted wilt virus adlı viral etmenlerinin yaygınlığının belirlenmesi ve etmenlerin moleküler karakterizasyonun gerçekleştirilmesi hedeflenmiştir. Bu amaç için Ödemiş ilçesinden 18, Bayındır ilçesinden 20, Torbalı ilçesinden 117, Menderes ilçesinden 9 ve Tire ilçesinden 22 adet virüs benzeri belirti gösteren domates bitki örneği toplanmıştır. Biber bitki örnekleri ise Ödemiş ilçesinden 10, Bayındır ilçesinden 13, Torbalı ilçesinden 11, Menderes ilçesinden 43 ve Tire ilçesinden 29 adet olmak üzere toplanmıştır. Uygulanan DAS-ELISA testi sonucunda toplanan toplam 186 domates örneğinin 40’ında (%21.50) CMV ve 40’ında (%21.50) TSWV enfeksiyonu olduğu saptanmıştır. Toplanan 106 biber örneğinin ise 27’sinde (%25.47) CMV ve 68’inde (%64.15) TSWV enfeksiyonu olduğu belirlenmiştir. DAS-ELISA testi sonucunda pozitif bulunan örnekler CMV’nin RNA 3 ve TSWV’nin S RNA segmentine ait spesifik primerler kullanılarak RT-PCR testi ile çoğaltılmıştır. Domates CMV izolatının gen bankasındaki diğer izolatlarla benzerlik oranları %98-95 arasında bulunurken biber CMV izolatının benzerliği %100-98 arasında değişmiştir. Biber TSWV izolatı gen bankasındaki diğer izolatlar ile %99-41 arasında değişen oranda benzerlik göstermiştir.