Antibiyofilm potansiyeline sahip biyosürfaktan üreticisi mayaların izolasyonu taranması ve moleküler karakterizasyonu
Proje no. 23404 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2022
Özet
Sürfaktanlar, sahip oldukları hidrofobik kuyruk ve hidrofilik baş grubu nedeniyle iki faz arasında birikerek yüzey ve arayüzey gerilimini düşürebilen yüzey aktif maddelerdir. Kompleks yapıdaki sentetik sürfaktanların mikrobiyal biyotransformasyonu zor olduğundan, bu kirleticilerin çevrede birikimi canlı sistemlerde toksisiteye neden olmaktadır. Biyosürfaktanlar ise mikroorganizmalar tarafından üretilen ve sentetik sürfaktanlarla eş fonksiyona sahip moleküllerdir. Biyodegredasyona yatkınlığı, düşük toksisitesi ve kimyasal çeşitliliği gibi avantajları nedeniyle biyosürfaktanlara ilişkin çalışmalar ve endüstriyel kullanımı giderek artmaktadır. Antibiyofilm, antimikrobiyal, antiviral aktivite gibi çeşitli biyolojik aktiviteleri de medikal uygulamalardaki potansiyeline işaret etmektedir. 2019’da 1.5 milyar $’ı aşan biyosürfaktanların pazarının, 2020-2026 yılları arasında 2.5 milyar $’a ulaşacağı tahmin edilmektedir. Tüm bu veriler, mikrobiyal kaynaklı yeni biyosürfaktanların araştırılmasındaki gerekliliği vurgulamaktadır.<br /> Bu projde, petrol türevleriyle kontamine olmuş toprak örneklerinden antibiyofilm potansiyeline sahip biyosürfaktan üreticisi mayaların izolasyonu amaçlanmaktadır. Mayaların biyosürfaktan potansiyelleri; oil displacement assay, drop collapse assay, parafilm M testi, hemoliz testi, CTAB agar testi ve emülsifikasyon indekslerinin (E24) hesaplanmasını içeren tarama testleri ile belirlenecektir. En iyi sonucu veren maya suşlarının üretttiği biyosürfaktanların yüzey gerilimini düşürme potansiyelleri tensiyometre ile ölçülecektir. Bu maya suşlarının genomik DNA’ları saflaştırılarak 26S rDNA bölgeleri PCR ile çoğaltılacak ve ürünlerin dizi analizi ile moleküler identifikasyonları yapılacaktır. Ayrıca, en iyi sonuçların alındığı biyosürfaktanların antibiyofilm aktiviteleri, Salmonella suşları tarafından üretilen biyofilmlere karşı kristal viyole denemesi ile kolorimetrik olarak Taramalı Elektron Mikroskobu ile de görsel olarak değerlendirilecektir. Mevcut çalışma ile, endüstriyel öneme sahip ancak çevreye zararlı olan sentetik sürfaktanlarla yer değiştirebilecek doğa dostu biyosürfaktanların keşfedilip literatüre kazandırılmasının yanı sıra antibiyofilm ajanı olarak gıda ve medikal endüstride kullanım potansiyeline sahip biyosürfaktanların belirlenmesi planlanmaktadır.