ZRF1’in THP-1 Makrofaj Modelinde İnflamasyon Koşullarında S100A8 ve S100A9 Protein Düzeyleri Üzerindeki Düzenleyici Etkisinin Araştırılması
Proje no. 33299 · Durum: Kapanmış · 2025
Özet
<p>ZRF1 (Zuotin ile ilişkili faktör 1), gen ekspresyonunun epigenetik düzeyde düzenlenmesinde görev alan, farklılaşma, stres yanıtı ve tümör progresyonu gibi süreçlerde işlev gören kromatinle ilişkili bir proteindir. Laboratuvarımızda meme kanseri hücrelerinde gerçekleştirilen RNA dizileme analizleri, ZRF1’in susturulmasının ardından S100A8 ve S100A9 genlerinin ekspresyonunda sırasıyla 29 ve 36 katlık artışlar meydana geldiğini göstermiştir. Bu bulgu, ZRF1’in S100 protein ailesi üzerinde baskılayıcı bir transkripsiyonel rol oynayabileceğini ve inflamasyonla ilişkili genlerin kontrolünde görev alabileceğini düşündürmektedir.</p><p><br></p><p>S100A8 ve S100A9, fizyolojik olarak nötrofiller, monositler ve makrofajlarda yüksek düzeyde eksprese edilen, kalsiyum-bağımlı alarmin proteinlerdir. Hücre dışında DAMP olarak görev yaparak TLR4 ve RAGE reseptörleri üzerinden NF-κB ve mTOR gibi temel sinyal yolaklarını aktive ederler. Bu mekanizmalar aracılığıyla pro-inflamatuvar sitokin üretimini artırır, immün hücre göçünü ve inflamatuvar mikroçevrenin oluşumunu desteklerler. S100A8 ve S100A9 ekspresyonundaki artış, kronik inflamasyonun sürdürülmesinde ve doku homeostazının bozulmasında kritik rol oynar. Ancak bu proteinlerin gen ekspresyonunu düzenleyen transkripsiyonel mekanizmalar ve özellikle protein düzeyindeki regülasyonlarına dair literatürde sınırlı veri bulunmaktadır.</p><p><br></p><p>Bu proje, önceki bulgularımız doğrultusunda ZRF1 eksikliğinde ve inflamasyon koşullarında S100A8 ve S100A9’un intraselüler ve ekstraselüler protein düzeylerindeki değişimlerin sistematik olarak incelenmesini amaçlamaktadır. Ayrıca, ZRF1’in inflamatuvar uyaranlara yanıt olarak nükleer ve sitoplazmik kompartmanlar arasında gösterdiği dinamik yer değişiminin fraksiyonlama yöntemiyle analiz edilmesi planlanmaktadır. Bu yönüyle proje, ZRF1’in inflamasyon ve alarmin regülasyonundaki epigenetik rolüne ilişkin mevcut literatür boşluğunu doldurmayı ve immün yanıt mekanizmalarının epigenetik düzeyde anlaşılmasına özgün bir katkı sağlamayı hedeflemektedir.</p>