Yüksek verimli tarama yöntemi ile V. harveyi bakteriyofajlarının izolasyonu, genomik karakterizasyonu ve biyokontrol etkinliklerinin değerlendirilmesi
Proje no. 32655 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2024
Özet
<p>Su ürünleri yetiştiriciliği, hızla artan dünya nüfusunun kaliteli protein ihtiyacını karşılamada kritik bir sektördür. Ancak bu alanda karşılaşılan bakteriyel hastalıklar, üreticiler için ciddi ekonomik kayıplara yol açmaktadır. Antibiyotiklerin kontrolsüz ve uzun süreli kullanımı, antibiyotik direncinin (AMR) gelişmesine ve bu direncin yayılmasına zemin hazırlamakta, böylece enfeksiyon tedavilerinin etkinliğini önemli ölçüde azaltmaktadır. Bu durum, tedavilere yönelik alternatif stratejilerin araştırılması ihtiyacını doğurmuştur. Bu stratejilerden biri olarak öne çıkan bakteriyofajlar (fajlar), bakterilere özgü virüslerdir. Fajlar, patojenik bakterileri kontrol etmek ve inhibe etmek için çevre dostu bir alternatif sunmaktadır. Akuakültürlerde sıkça karşılaşılan <em>Gammaproteobacteria</em> sınıfından <em>Vibrionaceae</em> familyası üyeleri ve bu üyelerden biri olan <em>Vibrio harveyi</em>, balık sağlığını bozan bakteriyel etmenlerin en önemlisidir. Küresel iklim değişikliği ile birlikte artan deniz suyu sıcaklıkları, <em>Vibrio </em>türlerinin neden olduğu vibriozis vakalarında yüksek mortalitelere ve ciddi ekonomik kayıplara yol açmaktadır. Bu proje kapsamında<em>, V. harveyi</em> kaynaklı balık enfeksiyonlarının biyokontrolü için yeni fajların izolasyonu ve karakterizasyonu amaçlanmıştır. Bu kapsamda ilk olarak, akuakültür çiftlik sularından bakteriyofaj izolasyonları gerçekleştirilecektir. İzole edilen her bir fajın karakterizasyonu sırasında, öncelikle fajların konak aralığı ve litik aktivitesi, ardından optimal pH, sıcaklık ve enfeksiyon oranları belirlenecektir. Bu süreçlerin ardından, fajların elektron mikroskobu ile morfolojik incelemeleri yapılacak ve genom analizleri gerçekleştirilecektir. Her bir fajın bireysel anti-bakteriyel ve anti-biyofilm kapasiteleri belirlenerek çeşitli faj kombinasyonları oluşturulacaktır. Projemiz su ürünleri yetiştiriciliğinde yeni tedavi stratejilerinden biri olan faj terapisi çalışmalarına katkı sağlayacak ve antimikrobiyal dirençle mücadelede tek sağlık yaklaşımı çerçevesinde önemli bir model teşkil edecektir.</p>