Pankreatik Duktal Adenokarsinom in vitro Modelinde Kinürenin Yolağının Hedeflenmesi
Proje no. 23636 · Durum: Kapanmış · 2022
Özet
Pankreatik kanser, dünyadaki en ölümcül malign neoplazilerden biri olup, günümüzde halen kemoterapi, radyoterapi ve cerrahi operasyonu içeren standart tedaviyi gören hastalarda 5 yıllık sağ kalım oranı %5-8 seviyesinde kalmaktadır. Etkili bir tarama prosesinin ve ayırıcı semptomlarının bulunmayışı diagnozda geç kalınmasına neden olmaktadır. Geleneksel tedavi yöntemleri ve küratif cerrahinin hastaların yaşam oranlarında sağladığı iyileşme oldukça kısıtlıdır. Bu yüzden pankreatik duktal adenokarsinomda hedefli tedavilerin geliştirilmesine ihtiyaç vardır. Kinürenin ya da triptofan katabolizması yolağı hücre içinde NAD+ üreten majör yolaktır. NAD+, kanser agresivitesinde önemli rolleri olan glikoliz, hipoksi sinyali ve pentoz fosfat yolaklarında görev alan anahtar enzimler için kofaktördür. Bu çalışmanın biyoinformatik ön araştırma verilerinde, triptofan katabolizmasındaki (kinürenin yolağı) hız kısıtlayıcı enzim olan kinüreninaz enzimini kodlayan KYNU gen ekspresyonunun The Cancer Genome Atlas (TCGA) pankreatik duktal adenokarsinom (PAAD) kohortunda tümörde normal göre daha yüksek oranda eksprese olduğu belirlenmiştir (p<0,01). Bu yüksek ekspresyonun TCGA PAAD kohortunda düşük genel sağ kalım ile korele olduğunu ve mRNA ekspresyonunun TNM evreleme ile korele olduğunu literatürde ilk kez gösterdik. Ayrıca, KYNU gen ekspresyonunun glikoliz, hipoksi sinyali ve pentoz fosfat yolaklarında görev alan ve NAD+ tüketen kilit enzimleri kodlayan genler ile birlikte eksprese olduğunu gösterdik. Bu veriler kinürenin yolağının pankreatik kanser tedavisinde etkili bir hedef olabilme potansiyelini de ortaya koymuştur. Çalışmamızda PANC-1 pankreatik kanser in vitro modelinde kinürenin yolağında görev alan kinurenin 3-hidroksilaz enzimini hedefleyen ve böylelikle Kinüreninaz (KYNU) enziminin substrat miktarını azaltan Ro-61-8048 ve kinüreninaz inhibitörü olan 3-hidroksihipürik asit farmakolojik inhibitörlerinin hücre canlılığı üzerine olan etkileri kristal viyole yöntemiyle belirlenecek olup, Ro-61-8048 ve 3-hidroksihipürik asit aracılı farmakolojik inhibisyonunun hücre mobilitesi üzerine etkileri yara iyileşme modeli ile değerlendirilecektir. Ayrıca farmakolojik ajan ile tedavinin PANC-1 hücre hattında NAD+/NADH+ oranı üzerine olan etkileri NAD/NADH tayin kiti kullanılarak kit üreticisinin talimatlarına göre gerçekleştirilecektir. Bu çalışma ile literatürde ilk defa Ro-61-8048 ve 3-hidroksihipürik asit inhibitörlerinin pankreatik kanser hücreleri üzerine etkisi belirlenecek ve kanser agresitivitesinde önemli rolleri olan biyokimyasal yolakları besleyen NAD+ üretimi üzerine olan etkisi değerlendirilecektir.