TDP-43 Kaybı ile SOCE Yolağı Arasındaki Olası İlişkinin Transkriptomik ve Hücresel Düzeyde Araştırılması
Proje no. 31901 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2023
Özet
<p>Nörodejeneratif hastalıklar, sinir sistemindeki nöronların işlev kaybı ve yapısal bütünlüğünün bozulmasıyla karakterize edilen bir grup hastalıktır. Bu hastalıklar genellikle ilerleyici bir seyir gösterir ve bu süreçte nöronal hasar artar. Günümüzde nörodejeneratif hastalıklar için etkili bir tedavi yöntemi bulunmamaktadır ve mevcut tedavi seçenekleri sadece semptomların hafifletilmesine veya ilerlemenin yavaşlatılmasına yöneliktir.</p><p>TDP-43 (TAR DNA-bağlayan protein 43) proteini, ALS (Amyotrofik Lateral Skleroz) ve FTLD (Frontotemporal Lob Dejenerasyon) gibi nörodejeneratif hastalıklarla ilişkili olan bir RNA bağlayıcı proteindir. TDP-43'ün işlev kaybı, hastalık sürecinde RNA işleme üzerinde değişikliklere neden olabilir. Bu nedenle, TDP-43 ile ilişkili patojenik mekanizmaların daha iyi anlaşılması için TDP-43'ün hedeflerinin belirlenmesine ihtiyaç duyulmaktadır. Nörodejeneratif hastalıkların patolojisi, hatalı katlanmış proteinlerin birikimi ve nöronal dejenerasyon üzerine birçok çalışma bulunmaktadır. Ancak, TDP-43'nün RNA metabolizmasındaki kesin rolü hala tam olarak anlaşılamamıştır. Bu proje kapsamında, mevcut RNA-seq ve CLIP-seq verileri kullanılarak TDP-43'nün hedef aldığı transkriptlerin biyoinformatik analizler ile belirlenmesi planlanmaktadır. Daha sonra, aday genlerde kriptik ekzon oluşumu hücre kültürü ortamında doğrulanacaktır. Bu çalışma, biyoinformatik analizlerle TDP-43'nün RNA işleme üzerindeki etkilerini ve potansiyel hedef genlerini belirlemeyi amaçlamakta ve bu alandaki bilgi boşluğunu doldurmayı hedeflemektedir. Ayrıca bu çalışma, TDP-43 proteinopatilerinde etkili olan genlerin sayısına katkıda bulunarak hastalık mekanizmalarının anlaşılmasına yardımcı olabilecektir.</p>