LACTOBACİLLUS PLANTARUM TÜRLERİNİN İZOLASYONU , MOLEKÜLER TANISI VE CRISPR ANALİZİ
Proje no. 580 · Durum: Kapanmış · 2016
Özet
Sofralık zeytinler dünyadaki başlıca fermente gıdalardan biridir. Laktik asit bakterileri (LAB), sofralık zeytinlerin fermantasyonunda ana role sahiptir. Sofralık zeytin salamuralarında diğer türler, laktik asitten daha az etkilenen ve hızla büyüyen LAB'dan daha yavaş büyümektedir. Böylece fermentasyonun sonuna doğru LAB hakim kalmaktadır. Günümüzde fermente gıdaların tüketimi sağlık yararları, besin değerleri, duyusal özellikleri ve işlevselliği nedeniyle teşvik edilmektedir. Bu özellikler yoğurt ve fermente süt gibi bazı gıdalar için çalışılmıştır. Ancak bitkisel fermantasyon konusunda geliştirilmesi gerekmektedir. Gelecek yılların mücadelesi, bu araştırma alanının geliştirilmesi ve yeni fonksiyonel gıdaların tasarımı olmalıdır. Bu bağlamda bitkisel fermentasyonlarda rol oynayan mikroorganizmaların hızlı identifikasyonu ileri çalışmalar için kolaylık sağlayacaktır. Bu çalışmada, İzmir ve Aydın çevresinden alınan 60 farklı ev tipi salamura zeytin suyundan 40 Lactobacillus sp. izolatı elde edilmiştir. Sırasıyla Lactobacillus ‘un izolasyonu ve identifikasyonu için kültürel yöntemler ve Real-Time PCR kullanılmıştır. Lactobacillus sp.'yi ve L.plantarum’ u identifiye etmek için rRNA intergenik aralayıcı bölgesini hedef alan prob ve primerler kullanılarak, dubleks 5' nükleaz aktivitesine dayalı analiz yapılmıştır. Sonuç olarak bu çalışma, Real-time PCR ile Taqman prob tekniğinin, Lactobacillus cinsi ve diğer müşkülpesent mikroorganizmaların saptanması, tür bazında ayrımı için hızlı ve tekrarlanabilir bir yöntem olarak uygulanabileceğini göstermektedir.