ALZHEMIER HASTALARINDA ABCA7 GENİNDE 44 BAZ ÇİFTLİK DELESYON(RS142076058)FREKANSININ ARAŞTIRILMASI
Proje no. 447 · Durum: Kapanmış · 2017
Özet
Alzheimer hastalığı (AD), yaşlı popülasyonda gözlenen demansın ana sebebi olan ve genetik olarak karmaşık bir hastalıktır. Erken başlangıç yaşına sahip ailesel AD tipi için üç gende (APP, PSEN1, PSEN2) 100'den fazla nadir, oldukça penetran mutasyon tanımlanmıştır. Daha yaygın olarak görülen geç başlangıç yaşına sahip AD formunda ise, apolipoprotein E (APOE)geni öne çıkmaktadır. Ancak; APOE geni mutasyonları hastalığa neden olan bütün genetik faktörleri açıklamamaktadır. Bu gen dışında toplam 25 ayrı genetik faktörle Alzheimer hastalığı arasında ilişki olduğu tahmin edilmektedir. Bunlardan biri de ABCA7 geninde tespit edilen 44-bp indel polimorfizmidir. Yapılan araştırmalarda bu mutasyon Afrika kökenli Alzheimer hastası Amerikan vatandaşlarında yüksek frekansta tespit edilmiştir. Proje kapsamında Çiğli Bölge Eğitim Hastanesi Böroloji Kliniğine devam eden 60 yaş üzeri hastalarda yapılan MR tetkikleri ile Alzheimer hastalığı teşhis edilen 50 hasta ve Alzheimer hastalığı yönünden sağlıklı olduğu tespit edilen 25 kontrol bireyinde ABCA7 geni 44-bp indel polimorfizminin varlığı PCR ile incelenmiştir. Analizler sonucunda, tek bir hasta örneği hariç, hasta ve kontrol örneklerinin tamamında ABCA7 geni 44-bp delesyon mutasyonu tespit edilememiştir. Tek bir hasta bireyde bu indel mutasyonu bakımından heterozigotluk tespit edilmiştir. Bu bireyin aile geçmişine bakıldığında ise, Afrika’dan Türkiye’ye yerleştikleri öğrenilmiştir. Literatürde de ilk defa bu indel mutasyonu Afrika kökenli Alzheimer hastalarında tespit edilmiştir. Afrika coğrafyasında bulunan hastalıklar, vektörler ve çevresel koşullar diğer coğrafyalara göre farklı genler üzerinde baskı yaratabilmektedir. Literatür bulgularına ve sonuçlarımıza baktığımızda AD’nin ABCA7 geni 44-bp delesyon mutasyonu ile ilişkisini destekleyecek bir elde edilmemiştir. Farklı bir etmen sebebiyle Afrika popülasyonları gen havuzunda seçilim gerçekleşirken ABCA7 geninde bulunan 44-bp delesyon mutasyonunun frekansı da AD’den bağımsız olarak seçici süpürme (selective sweep) ya da genetik otostop (genetic hitchhiking) sebebiyle artmış olma ihtimali yüksektir.