Genista spp.’den simbiyotik azot fikse edici bakterilerin izolasyonu ve filogenetik identifikasyonu
Proje no. 75599 · Durum: Kapanmış · 2022
Özet
<p>Günümüzde tarımsal amaçlı yetiştirilen baklagillerin köklerinde simbiyotik azot fiksasyonu gerçekleştiren <em>Rhizobial</em> türler ile ilgili araştırmalar yoğun olarak çalışılmaya devam edilmektedir. <em>Rhizobium</em>lar, Protobacteria'nın Alphaproteobacteria sınıfına ait Gram negatif, toprak bakterileridir ve baklagillerin kökleri ile simbiyotik bir ilişki kurabilirler. Bu simbiyoz önemlidir çünkü bitkiler azotu doğrudan kullanamazlar ve bu nedenle <em>Rhizobia</em> gibi azot fikse edici bakterilere ihtiyaç duyarlar. Bu bakteriler sahip oldukları <em>Nod </em>genleri sayesinde köklerde nodül oluştururlar ve azotu amonyağa dönüştürürler. Buna karşılık bitkiler de, <em>Rhizobiuml</em>ara fotosentez sonucu oluşan organik bileşikleri sağlarlar. Bu simbiyotik ilişki, tüm <em>Rhizobium</em> türleri için geçerlidir. Legümen <em>Genista </em>spp’nin endemik ve endemik olmayan türleri<em> </em>rhizobia olarak adlandırılan baklagil yumrulu bakteriler (LNB) ile nitrojen fiksasyon simbiyozları sayesinde, topraktaki nitrojen içeriğini ve organik maddeyi artırarak toprak verimliliğine katkıda bulunur. Yüksek kaliteli hayvan yemi sağlarlar, erozyonu önlerler ve toprak stabilizasyonuna ve ekosistem restorasyonuna katkıda bulunurlar. Ülkemiz türlerine ait yapılan bir çok çalışmada, nodül oluşturan bakterilerin tür tayinleri 16S rRNA’ya yönelik olup; ek olarak kısmi diğer genler (<em>nifH</em> ve <em>nifD </em>genleri gibi) için dizi verileri elde edilmiştir. Bu çalışmada ise, <em>Genista sp</em>.’den mikrobiyolojik yöntemler ile izole edilecek simbiyotik azot fikse edici bakterilerin moleküler analizi sadece 16S rRNA üzerinden yapılmayacak olup <em>NifH</em>, <em>AtpD, recA, Rpoh, NodC, NifD</em> gibi diğer genlerinin üzerinden karşılaştırmalı filogenetik analizler ile tür tayini yapılacaktır. </p>