Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanserli Olguların Ekshale Soluk Kondensat Örneklerinde Spesifik miRNA’lar ile E-cadherin ve Vimentin İfadelerinin İlişkisinin Araştırılması.
Proje no. 32511 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2024
Özet
<p>Akciğer kanseri, tüm dünyada kansere bağlı ölüm nedenleri arasında ilk sırada yer almaktadır. Ortalama 5 yıllık sağkalım oranı sadece %15’tir. Küçük hücreli akciğer kanseri (KHAK) ve küçük hücre dışı akciğer kanseri (KHDAK) olmak üzere iki ana sınıfa ayrılmaktadır. Dokunun incelenmesi; metastaz değerlendirmesi, evreleme, tanı ve tedavi sürecinde önemlidir. Erken tanı, uzun survey sağlayabilmek adına çok önemlidir. Mevcut tanı yöntemleri invaziv yöntemler olup hasta açısından uygulamada zorluklara neden olmaktadır. Non-invaziv yöntemlerin geliştirilmesi, erken tanı koyabilmek adına gereklidir.</p><p>Ekshale soluk havası kondensatı (EBC), soluk havasının soğutulması ve yoğunlaştırılması ile elde edilmektedir. EBC örneklerinden yapılan genomik, proteomik ve epigenomik analizler ile tümoral dokunun profili hakkında bulgular elde etmek mümkündür. Kan veya doku üzerinden örnekleme yapılması ile EBC örneklemeleri karşılaştırıldığında, EBC'nin tercih edilmesi hastalar için uygulama kolaylığı ve konfor eldesi sağlayacaktır. KHDAK için günümüze ulaşan başka amaçlı EBC çalışmaları da mevcuttur. Bu durum, EBC örnekleme yöntemininin uygulanabilir olduğunu işaret etmektedir.</p><p>miRNA’lar, KHDAK olgularında disregüle durumdadır ve onkogenlerle ilişkilidir. Belirli miRNA profilleri, prognoz ve nüks gelişimi ile ilişkilendirilmektedir. Kan ve doku örneklerinde miRNA ekspresyonlarının anlamlı olduğu, önceki çalışmalarda görüldü. Önceki çalışmalardan farklı olarak, KHDAK vakalarından elde edilen EBC örneklerinde miRNA aileleri ile vimentin/e-cadherin ekspresyon ilişkisi ilk kez çalışılacaktır. Ancak EBC örnekleri üzerinden vimentin/e-cadherin ve miRNA ilişkisini ortaya koyan çalışma henüz yok.</p><p>E-cadherin ve vimentin, epitelyal mezenkimal transisyon ile ilişkilidir. Benzer şekilde epitel hücrelerinin belirteci olan e-cadherin ve mezenkim hücrelerinin belirteci olan vimentin tümoral dokularda anlamlı ekspresyon değişimleri göstermektedir. Literatür taramaları gösterdi ki günümüze kadar gelen kanıtlar kanserli akciğer dokusu ve kan örnekleri üzerinden sağlanmıştır. EBC üzerinden miRNA - Vimentin/E-cadherin ilişkisi anlamlı örnek elde edilebilirse noninvazif bir tanı yöntemi olarak uygulama kolaylığı ve yenilik getirecektir.</p><p>KHDAK vakalarından ve kontrol grubundan elde edilen EBC örneklerinde malignite ilişkili olduğu düşünülen yüzey markerları olan Vimentin/E-cadherin sisteminin ekspresyonunun belirlenmesi için ELIZA yöntemi tercih edilmiştir. Yine EBC örneklerinde miRNA ekspresyon analizlerinin çalışılması için qPCR uygulanacaktır. Önceki çalışmalar EBC örneklerinde miRNA analizleri açısından örnekler sunmuştur, ancak EBC örneklerinde Vimentin/E-cadherin ile miRNA ekspresyon ilişkisi ortaya konulmamıştır. miRNA ekspresyon profillerinin belirlenmesi için EBC örnekleme protokolü ve qRT-PCR protokolü belirlenmiştir. Vimentin ve E-cadherin ekspresyonları ELIZA yöntemi ile belirlenecektir.</p><p>Belirli miRNA profilleri, vimentin ve e-cadherin ekspresyonuyla ilişkilendirilmekte ve bu spesifik miRNA profilleri (miRNA-34a, miRNA-374a, miRNA-27, miRNA-503, miRNA-1271, miRNA-10b, miRNA-346, miRNA-23a, miRNA-30a, miRNA-193a) epitelyal mezenkimal transisyon üzerinden malignite gelişimine etki etmektedir. Çalışma için seçilen miRNA'lar (miRNA-34a, miRNA-374a, miRNA-27, miRNA-503, miRNA-1271, miRNA-10b, miRNA-346, miRNA-23a, miRNA-30a, miRNA-193a), yüzey markerları olan vimentin/e-cadherin sistemi ile önceki çalışmalarda kan ve doku örneklerinde ilişkili bulunmuş olup EBC örneklerinde kanıtları henüz yoktur. Kan ve doku çalışmalarında anlamlı ilişki tespit edildiği halde EBC çalışmaları henüz bulunmadığı için bu miRNA'lar seçilmiştir. Seçilen miRNA profilleri ile vimentin/e-cadherin sistemi ilişkisinin EBC örnekleri üzerinde anlamlı bulunması halinde erken tanı ve prognoz açısından yeni bir gelişme elde edilebileceği öngörülmüştür. İlgili miRNA profillerinde anlamlı bulgu elde edilememesi durumunda çalışmada araştırılan miRNA ailesi genişletilerek çalışma devam ettirilecektir.</p><p>Non-invaziv bir yöntem olan EBC örneklerinde spesifik miRNAlar ile vimentin/e-cadherin ilişkisini belirleyeceğimiz bu çalışmada; ileri evre KHDAK’nde miRNAlar ile vimentin/e-cadherin ifadelerinin ilişkisinin, erken tanı sürecine katkı sağlayabilileceğini ve hastanın surveyini uzatabileceğini öngörmekteyiz.</p>