Leishmania İnfantum ile Enfekte Makrofajlarda Circular RNA Gen Ekspresyon Değişikliklerinin Değerlendirilmesi
Proje no. 32035 · Durum: Kapanmış · 2023
Özet
<p>Leishmaniasis, dünya çapında geniş bir dağılıma sahip olup ölüm oranında sıtmadan sonra ikinci paraziter hastalığı oluşturmaktadır. <em>Leishmania spp.</em> parazitinin tanısındaki ilerlemeler leishmaniasis tani duyarlılığını ve özgüllüğünü artırmış olsa da, hala üstesinden gelinmesi gereken bazı zorluklar vardır. <em>Leishmania spp.</em> iyi tanımlayabilecek hızlı ve erişilebilir testlerin geliştirilmesi, prognoz ve türe özgü tedaviler için büyük önem taşıdığı için tanıda bir dönüm noktası olacaktır. Ayrıca infeksiyonun gelişimine katkıda bulunan genlerin ve mekanizmalarının belirlenmesi, bu hastalığın kontrolu ve tedavisi için gelecekteki daha uygun tedavi stratejilerini oluşturabilir. Son yıllarda halkasal RNA (circRNA)'lar hastalıkların tanı ve tedavisinde ümit verici konulardan biri olmuştur. CircRNA’larin RNa eksonükleaz enzimlerine karsı dirençli olduklari için stabil bir yapı içermektedirler. Dahası, circRNA’lar bu ozellikleri ile vücut sivilarinda ve dokularinda bozulmadan bulunmalarına neden olmaktadır. Günümüzde, circRNA ve <em>Leishmania</em> <em>spp</em>. konusunda ise herhangi bir araştırma bulunamamıştır. circRNA’lar <em>Leishmania'</em>nın gelişimi ve ilerlemesi ile ilgili mekanizmaların aydınlanmasına yardımcı olabilir. Ayrıca bu circRNA'lar leishmaniasis prognozu için biyobelirteçler adayları olabilir veya yeni tedavi hedefleri olarak fayda sağlayabilir. Bu tez önerisinde, <em>L. infantum</em> ile makrofajlarin enfeksiyonu oluşturulacaktır. Sonra bu örneklerden RNA elde edilecek ve cDNA sentezi gerçekleştirilecektir. Arkasindan qPCR yöntemiyle hedef circRNA’ların ekspresyon miktarları belirlenecektir. Sonuçlar analiz edilerek anlamlı seviyede farklı bulunan circRNA’lar biyobelirteç adayları olarak tanımlanacaktır. Farklı düzeyde eksprese edilen circRNA’lar ile iliskili mRNA'lar tanımlanacak ve bu mRNA’larin ekspresyon profilleri belirlenecektir. Sonuçlara dayanarak, <em>L. infantum</em> tanısında biyobelirteç olabilecek circRNA moleküllerinin ve infeksiyondaki rollerinin tanımlanması planlanmaktadır. Bu tez önerisi ile literatürde ilk olarak <em>Leishmania</em> ve circRNA arasındaki ilişki ilk olarak araştırılmış olacak ve <em>Leishmania</em>'nın temel biyolojisini anlamaak için yeni bilgiler sağlayacaktır.</p>