Cytogenetics and DNA Barcoding of Pimelia Fabricius, 1775 (Coleoptera: Tenebrionidae) Species from Turkey
Project no. 20600 · Status: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2019
Summary
<p>Bu projede Türkiye’de dağılış gösteren <em>Pimelia</em> türleri sitogenetik yöntemler ve DNA barkodlama yaklaşımı ile çalışılacaktır. Türkiye’de dağılış gösteren 11 türden 8 tanesi <em>Camphonota</em> altcinsine dahildir ve ülkemize endemizm /subendemizm gösterirler.</p><p>Arazi çalışmalarında toplanacak olan örneklerin gonadlarının çalışılması ile kromozomal özellikleri belirlenecektir. Kromozom preparatları; Giemsa, AgNO3 ve DAPI gibi farklı boyama yöntemlerinin kullanılmasıyla hazırlanacaktır. Kromozom setlerinin analiz edilmesi sonucunda, bu türlerle ilgili ilk sitogenetik veriler elde edilecektir.</p><p>DNA barkodlama yaklaşımı ile sitokrom oksidaz I gen bölgesi çalışılarak; tür sınırları belirlenecek, elde edilen barkod verileri BOLD sistemine girilecektir. PCR prosedürü sonrası elde edilen diziler çeşitli biyoinformatik programlar kullanılarak analiz edilecek ve elde edilen ağaçlar yorumlanacaktır.</p><p>Proje sonucunda; çok sayıda türe sahip olan <em>Pimelia</em> cinsindeki sitogenetik veri eksikliğinin yanı sıra; Türkiye Tenebrionidleri ile ilgili veri eksiklikleri de doldurulacaktır. Türkiye’de dağılış gösteren türlerin yayılışları, arazi çalışmaları doğrultusunda güncellenecek ve COI dizilerinin çalışılmasıyla da tür sınırları ve <em>Camphonota</em> altcinsinin monofilisi test edilecektir.</p><p>Proje kapsamında çalışılacak olan örnekler; kromozomları ve genomik DNA’ları elde edildikten sonra %100 etanol içeren tüplerde, -20°C’de muhafaza edilecek ve ZDEU-Ent koleksiyonuna kaydedilecektir. Genomik DNA’lar da, ileride kullanılmak üzere etiketlenerek -80°C’de dondurularak saklanacaktır.</p>