Koyunlarda Viral Hastalık Maedi-Visna'ya Karşı Aşı Geliştirilmesinde Antijenik Epitopların Keşfi
Proje no. 23604 · Durum: Kapanmış · 2022
Özet
Maedi Visna (MVV), klinik ve patolojik bulguları yönünden iki ayrı formda gözlenen koyunların kronik viral bir hastalığıdır. Hastalığın maedi formu ilerleyici bir interstisyel pnömonidir, Visna formu ise bir meningoensefalittir. Bu hastalığa karşı günümüzde halen etkin bir tedavi yöntemi ve aşı bulunmadığından hayvancılık sektöründe büyük ekonomik kayıplar yaşanmaktadır. Diğer taraftan gelişen bilgisayar tabanlı programlar aşı çalışmalarının en önemli adımını oluşturan antijenik proteinlerin ve protein amino asit sekansları içerisinde epitop adı verilen bölgelerin keşfi için büyük olanaklar sağlamaktadır. Bu sayede kısa zamanda büyük harcamalara gerek kalmadan patojen mikroorganizmaların genomları analiz edilebilmekte ve böylece aşı çalışmaları için önemli proteinler seçilebilmektedir. Dahası, seçimi yapılan epitoplar günümüz teknolojisi koşullarında kısa zamanda sentezlenerek, daha önceden hastalığı geçirmiş konaklardan toplanan serum örneklerinin kullanımı ile in vitro koşullarda immünojenitesi test edilebilmektedir. Buradan yola çıkarak Maedi Visna virüsünün gag ve env adı verilen yapısal proteinleri antijenisite, B ve T hücre epitop bölgelerinin keşfi ve docking analizlerinin dahil olduğu çok sayıda biyoinformatik ve immünoinformatik analizleri içeren bir yaklaşım ile ilk kez analiz edilecek ve içlerinden aşı çalışmalarında kullanılabilecek en yüksek antijenisite değerine sahip, allerjen olmayan, çözünür özellikte, MHC-I ve MHC-II molekülleri ile yüksek bağlanma affinitesine sahip en ideal B ve T hücre epitopları saptanacaktır. Sonrasında seçilen epitoplar sentezlenip immünojenisiteleri in vitro koşullarda ELISA yöntemi ile çok iyi kategorize edilmiş “Bandırma Koyunculuk Araştırma Enstitüsü” arşivinde tutulan Maedi Visna pozitif koyunlardan toplanmış serum örneklerinin kullanımı ile test edilecektir. Sonuç olarak, veteriner hekimlikte önemli bir viral hastalık olan Maedi Visna virüsüne karşı peptit aşısı geliştirilmesi sırasında kullanılabilecek peptitler ilk kez saptanmış olunacaktır.