Kalıtsal Anemi Tanılı Hastalarda Tüm Ekzom Dizi Analizi ile Moleküler Genetik Tanının Araştırılması ve Sorumlu Yeni Genlerin Keşfi
Proje no. 21906 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2020
Özet
Giriş: Kalıtsal hemolitik anemiler eritrosit yapımında veya yapısında go¨revli proteinleri kodlayan genlerdeki mutasyonlardan kaynaklanan bir grup genetik heterojen hastalıktır. Klinik bulgular ve konvansiyonel laboratuvar tetkikleri ile altta yatan spesifik etiyolojiyi belirlemek her zaman mümkün değildir. Yeni nesil dizi analizi kalıtsal hemolitik anemilerin tanısında o¨nemli avantajlar sağlar. Ancak halen daha kullanılmakta olan hedeflenmis¸ yeni nesil dizi analizi panelleri ile hastaların %20-40’ında moleküler tanı konulamamaktadır. O¨zellikle nadir tiplerden sorumlu olan genetik defektlerin ortaya konulabilmesi ic¸in genis¸ kapsamlı moleküler c¸alıs¸maların yapılması gerekmektedir. Bu c¸alıs¸ma ile kalıtsal hemolitik anemilerden sorumlu yeni aday genlerin kes¸fedilmesi, tedavi ic¸in aday olabilecek yeni moleküler hedeflerin ortaya konulması ve genotip-fenotip ilis¸kisinin genis¸letilmesi amac¸lanmıs¸tır. Yöntem: Bu c¸alıs¸maya, kalıtsal hemolitik anemi tanısı ile takip edilen ve Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi (EÜTF) Çocuk Genetik Hastalıkları Bilim Dalı’nda moleküler analizleri yapılmıs¸ ancak hastalıktan sorumlu moleküler etiyoloji belirlenememis¸ olan ve aile ağacı otozomal dominant veya otozomal resesif kalıtım ile uyumlu olan altı aileden 13 olgu alındı. Dokuz olguya tüm ekzom dizi analizi yapılarak sorumlu aday genler aras¸tırıldı. Bulgular: Tüm ekzom dizi analizi sonucunda bes¸ ailede kalıtsal hemolitik anemiden sorumlu olduğu bilinen iki gende (HBB ve PKLR) üc¸ farklı varyant saptandı. Olgu 13’te ise moleküler etiyoloji belirlenemedi. Sonuç: Bu c¸alıs¸ma sonucunda daha o¨nce ClinVar veritabanına benign olarak kaydedilmis¸ olan PKLR c.1516G>A varyantının (rs8177988) patojenik olduğuna dair veriler elde edilmis¸tir. Tüm ekzom sekanslama ileri fonksiyonel c¸alıs¸malar ic¸in gerekli o¨n verinin elde edilmesini sağlamıs¸tır.