Avrupa Levreğinde Dicentrarchus labrax Büyüme Hormonu GH ve Miyostatin MSTN Genlerindeki Polimorfizimler ile Büyüme Özellikleri Arasındaki İlişkilerin Belirlenmesi
Proje no. 21912 · Durum: Kapanmış · 2020
Özet
Proje kapsamında Avrupa levreği (Dicentrarchus labrax) büyüme hormon (GH) geni ve miyostatin (MSTN) genlerindeki tek nükleotid polimorfizmleri (SNPs) DNA dizilemesi yöntemiyle belirlenmiş ve bu SNP’lerin büyüme özellikleriyle ile olası ilişkileri araştırılmıştır. Çalışmada 200 Avrupa levreğinde birinci intron, ikinci ekzon ve intron, kısmi üçüncü ekzon bölgelerini kapsayan 576 bç’lik GH geninde toplam 10 tane SNP belirlenmiştir. GH geni birinci intron; g.1557 A>T lokusunun abdominal uzunluk ve pre-anal uzunlukla, g.1611 T>C lokusunun total ağırlık, fileto ağırlığı, baş uzunluğuyla; g.1663 C>G lokusunun abdominal uzunlukla ilişkili olduğu belirlenmiştir. GH geni g.1663 C>G lokusunun ve ikinci ekzondaki Lösin (L)’den Serin (S)’e nonsinonim aminoasit değişikliğine neden olan g.1799 T>C nükleotid değişiminin vücut uzunluğu ile ilişkisi önemli bulunmuştur (p<0.05). MSTN geninin birinci, ikinci ve üçüncü ekzon bölgelerini içine alan toplam 2375 bç’lik bölgenin dizi analizi sonuçlarına göre; toplam 9 adet SNP ve 2 adet indel tespit edilmiştir. MSTN geni birinci intron bölgesinde bulunan g.16612A indelinin standart boyla; 2. intron bölgesindeki g.15252T>A lokusunun ise toplam ağırlık, fileto ağırlığı, standart boyla ilişkili olduğu belirlenmiştir. GH geni üçüncü ekzondaki; g.14873C>T lokusunun standart boy, baş uzunluğu, vücut uzunluğu, pre-anal uzunluk, abdominal uzunluk, post-anal uzunluk, baş genişliği ile ilişkisi önemli bulunmuştur (p<0.05). GH ve MSTN genleri akuakültür türlerinde büyüme özellikleri için önemli aday genlerdendir. Bu nedenle, çalışmada her iki gen bölgesinde tanımlanan SNP'lerin Avrupa levreği yetiştiriciliği ve markör destekli seçim (MAS) için aday SNPler olarak değerlendirilmesi önerilmektedir.