Psödoeksfoliatif glokomlu gözlerde humör aköz transkriptom analizi
Proje no. 29593 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2023
Özet
<p>Giriş ve Hipotez: Psödoeksfoliasyon sendromlu (PXS) gözlerin bir çoğunda hayat boyu glokom gelişmemekte, yalnızca küçük bir bölümü glokom geliştirmektedir. Hipotezimize göre bu durumun nedeni, eksfoliatif glokom (XG) geliştiren hastalar ile PXS’li hastalar arasında gen ekspresyonu düzeyinde farklılıkların bulunmasıdır. Bu çalışmada amaç XG gelişiminde rol oynayan gen ifadesi farklılıklarının aydınlatılmasıdır.</p><p>Bu amaçla PXS olup glokom gelişmemiş gözler, XG tanılı gözler ve sağlıklı gözlerden HA örnekleri katarakt ameliyatlarının başlangıcında alınacak, satrifüj ve supernatanta TRIzol eklenmesinin ardından RNA izolasyon işlemine kadar -800C saklanacaktır. Trizol yöntemi ile tüm örneklerden total RNA izolasyonu gerçekleştirilecektir. Örneklerin konsantrasyon ölçümleri fluorometrik olarak yapıldıktan sonra RNA Integrity Number (RIN) değerleri BioAnalyzer (Agilent) cihazında belirlenecektir. HA RNA’larının transkriptom dizilemesi üçüncü nesil sekanslama yöntemlerinden olan Nanopore uzun okuma teknolojisi kullanılarak gerçekleştirilecektir. Ham dizileme verileri EPI2ME ve R yazılımları ile analiz edilecektir.</p><p>Çalışmamız, ülkemizde oldukça sık görülen XG vs PXS’nun genetik temeli ve gen ekspresyon düzeyleri arasındaki farklılıkları ortaya koymayı sağlayacak, XG için risk faktörlerinin aydınlatılmasına yardımcı olacak ve biyo-belirteç belirleme ve gen ekspresyonu üzerine etkili ilaç geliştirme çalışmalarına öncülük edecektir.</p><p>Özgün değeri: Araştırmalarımıza göre bu çalışma psödoeksfoliatif glokomda yapılan ilk humör aköz transkriptom analizi çalışması olacaktır. Bu sayede XG gelişimi için biyo-belirteç olarak kullanılabilme potansiyeli olan proteinler ve ilgili genler belirlenecektir.</p><p>Hastalıkla ilişkilendirilen genlerin kodladığı proteinlere karşı potansiyel ilaç geliştirme çalışmalarına zemin oluşturarak hastaların yaşam kalitesinin artmasına yönelik dolaylı bir etki sağlanacaktır.</p>