" HELİCOBACTER PYLORİ HP1437 PROTEİNİN TIR DOMAİN PROTEİN OLARAK KARAKTERİZASYONU, REKOMBİNANT ÜRETİMİ, SAFLAŞTIRILMASI VE MYD88/TIRAP İLE ETKİLEŞİMİNİN ARAŞTIRILMASI"
Proje no. 534 · Durum: Kapanmış · 2015
Özet
Bu projede Helicobacter pylori HP1437 proteinin bir bakteriyal TIR domain protein (BTP) olarak tanımlanması ve karakterizasyonu hedeflenmiştir. H.pylori gastrik kanser de aralarında olmak üzere bir çok mide rahatsızlığına yol açan önemli bir patojendir. H.pylori bağışıklık sisteminden kaçmayı başarır ve uzun yıllar gastrik mukozada varlığını sürdürür. Bu projede H.pylori’nin de diğer patojenler gibi bağışıklık sistemini yönlendirmede kullandığı TIR domain proteinleri olduğu öngörülmüştür. Biyoinformatik aramalar ile olası TIR domain protein olarak HP1437 proteini tespit edilmiştir. HP1437 rekombinant olarak üretilmiş, saflaştırılmış ve yapısal kararlı yapı bölgeleri karakterize edilmiştir. Saflaştırılan HP1437’nin MyD88 ile etkileşimi in vitro olarak gösterilmiştir. Protein-protein etkileşimi görülmesi ile HP1437 proteininin insan TIR domain adaptör proteinlerine bağlanarak TLR sinyal iletimini kontrol ettiği tezi kuvvetlenmiştir. Bunlara parallel olarak homoloji modelleme ile HP1437nin üç boyutlu yapısı hesaplanmış ve TIR domain yapısına sahip olduğu gösterilmiştir. Bütün bu verilerle ilk defa H.pylori’nin TIR domain proteine sahip olduğu gösterilmiştir ve bu protein ilk defa biyoinformatik ve biyokimyasal yöntemlerle incelenmiştir.