İmmün Sistemi Sağlam ve İmmün Sistemi Baskılanmış Yatan Hastalarda Real Time PZR ile Pneumocystis jirovecii Pozitif Saptanan Olgularda Multilokus Sekanslama ile P jirovecii Genotiplerinin Belirlenmesi Bir Moleküler Epidemiyolojik Çalışma
Proje no. 20253 · Durum: Kapanmış · 2019
Özet
Pneumocystis jirovecii, immun sistemi baskılanmış hastalarda Pneumocystis pnömonisine (PcP) neden olan fırsatçı bir solunum sistemi patojenidir. Bu çalışmanın amacı, PcP hastalarından elde edilen P. jirovecii izolatlarının (n: 84) genetik çeşitliliğini mt26S, SOD ve CYB lokuslarına dayalı multilokus sekanslama yöntemi ile araştırmaktır. P. jirovecii cdc2 DNA pozitif olan 84 klinik örnek arasından 31'i (% 36.90) en az bir lokus kullanılarak genotiplendirilebilmiştir. 31 klinik örnekten 26'sı tüm lokuslar kullanılarak başarılı bir şekilde genotiplenirken, üç numune mt26S/CYB lokusları veya mt26S/SOD lokusları kullanılarak genotiplendirilmiştir. Ek olarak, CYB veya SOD lokusu kullanılarak genotiplenen iki klinik örnek daha vardır. Mt26S lokusu kullanılarak genotip 2, 3, 7 ve 8 tespit edilmiştir. Genotip 7 ve 8'in sıklığı daha yüksek bulunmuş ve her ikisi de 11 (n: 29;% 37.93) klinik numunede bulunmuştur. SOD lokusu kullanılarak SOD 1, 2 ve 4 genotipleri tespit edilmiştir. Bunlar içinde SOD 1’in baskın genotip olduğu görülmüştür (20/28;% 71.42). CYB lokusu analizleri sırasında, CYB 1, 2, 5, 6 ve 7 ile yeni bir CYB genotipi tespit edilmiştir. CYB1 (15/29;% 51.72) ve 2 (9/29;% 31.03) baskın genotipler olarak belirlenmiştir. Genel olarak, multilokus sekanslama sonuçlarına göre PcP hastaları arasında E, F, M, N, P ve V multilokus genotipleri tespit edilmiştir. Ek olarak, SOD 1’in baskın genotip olduğu ve CYB’nin ise daha polimorfik bir lokus olduğu tespit edilmiştir.