Biyoinformatik Yöntemlerden Yararlanarak Covid 19 Tedavisi İçin Virüs Lider Sekansının Baskılanmasına Etki Edebilecek Bitki Mikro RNA'larının Belirlenmesi
Proje no. 32615 · Durum: Kapanmış · 2024
Özet
<p>Covid 19, 2019 yılı Aralık ayında başlayan, yaklaşık bir ay gibi kısa bir sürede Dünya Sağlık Örgütü (DSÖ) tarafından “pandemi” olarak ilan edilen, ardından üç ay gibi bir süre içinde de tüm dünyada etkili olan viral bir hastalıktır. Covid 19 dördüncü yılını doldurmasına rağmen etkisini halen tüm dünyada göstermeye devam etmektedir. Bağışıklama uygulamaları için koruma aşıları yapılmakla birlikte virüs geçirdiği mutasyonlar ve bunun neticesinde oluşan yeni varyantları nedeniyle henüz kontrol altına alınamamıştır.</p><p>Biyoloji, genetik, bilgi teknolojileri ve bilgisayar bilimlerinin bir araya gelmesiyle oluşan multidisipliner bir çalışma alanı olan biyoinformatik, günümüzde oluştuğu bilim alanlarından elde edilen zengin veri havuzunu veri tabanları aracılığıyla araştırmacılara sunmaktadır. </p><p>Bu projede; Covid 19 hastalığının tek zincirli RNA virüsü yapısında olan SARS-CoV-2 virüsünün başlatıcı lider sekansı olan 5’ ucundaki kodlanmayan bölge (UTR/untranslated sequence) ile daha önce çeşitli araştırmalar sonucunda bitki miRNA veri bankalarına yüklenmiş olan Covid 19 üzerinde etkili mikro RNA’lar kullanılacaktır. Bu miRNA’ların Covid 19’un 5’UTR bölgesine bağlanma durumları biyoinformatik yöntemlerle incelenecek ve bu bölgeye bağlanarak virüs replikasyonunu baskılayan miRNA’lar tespit edilecektir. Ayrıca inaktif hale getiren ve hastalık sürecinin baskılanabilmesine yol açan bitki miRNA yapılarının termodinamik bağlanma enerjileri ve kararlılık durumları da biyoinformatik yöntemler ile belirlenecektir.</p><p>Elde edilen sonuçlar ile ileride bitki miRNA’ları kullanılarak Covid 19 virüsünün tedavisine yönelik çalışmalarda bu projede sonuçlarında belirlenmesi beklenen miRNA’lar kullanılarak bitki kökenli tedavilerden daha verimli sonuçların alınabilmesine imkan sağlayacaktır. </p>