TİROZİN KİNAZ İNHİBİTÖRLERİNE DUYARLI VE DİRENÇLİ KRONİK MYELOİD LÖSEMİ HASTALARINDA, UZUN KODLAMAYAN RNA EKSPRESYONLARININ MOLEKÜLER DÜZEYDE ARAŞTIRILMASI
Proje no. 17 · Durum: Kapanmış · 2016
Özet
Uzun kodlamayan RNA’ lar (lncRNA), ortalama 200-100 kbp uzunluğunda, hücrelerde gen ifadesinin epigenetik düzeyde kontrolünden sorumlu olan RNA molekülleridir. LncRNA’ ların ekspresyon düzensizliği çeşitli insan kanser tipleri ile ilişkilidir. Ancak, Kronik myeloid lösemi’ de (KML) ve özellikle tirozin kinaz inhibitörlerine karşı oluşan dirençte lncRNA’ ların fonksiyonları tam olarak bilinmemektedir. Uzun kodlamayan RNA NEAT1 çeşitli kanser türlerinde önemli role sahip olup, iki kısa izoforma sahiptir: kısa form NEAT1_1 ve uzun form NEAT1_2. NEAT1 aynı zamanda nukleusta sub bodies olan ‘paraspeckles’ ve microspeckles oluşumundan da sorumludur. Bu çalışmanın amacı KML’de ve tirozin kinaz inhibitörlerine karşı gelişen direnç mekanizmasında etki gösteren lncRNA ekspresyon profillerinin belirlenmesi ve belirlenen lncRNA’ların TKİ direnç mekanizmasında ve KML progresyonundaki rollerinin saptanmasıdır. Dolayısıyla KML’de gen ifadesini direkt veya dolaylı şekilde etkileyen lncRNA’ ların profillenmesi, sağlıklı olgulardan ve tirozin kinaz inhibitörlerine duyarlı/dirençli kronik myeloid lösemi hastalarından elde edilen kan örneklerinden RNAeasy Mini kit (Qiagen) ile total RNA izolasyonu, ‘Thermocycler’ cihazında qRT-PCR (kantitatif revers transkriptaz-gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu) yöntemi ile cDNA (komplemanter DNA) sentezi ve ‘ABI 7500 Fast’ cihazında qRT-PCR (gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu) array ile yapılmıştır. Farklı ekspresyon seviyeleri gösteren lncRNA’lar potansiyel terapötik hedefler olabileceğinden, lncRNA’ ları hedefleyen tedavi stratejisinin tirozin kinaz inhibitörlerine karşı direnç gösteren KML hastalarının tedavisi için de, umut verici nitelikte olacağını düşünmekteyiz. Anahtar Kelimeler: KML, LncRNA , Tirozin kinaz inhibitörlerine direnç