NEONATAL/ERKEN İNFANTİL BAŞLANGIÇLI EPİLEPTİK ENSEFALOPATİLERDEMOLEKÜLER GENETİK ETİYOLOJİNİN TÜM EKZOM DİZİ ANALİZİ İLEAYDINLATILMASI
Proje no. 71 · Durum: Kapanmış · 2017
Özet
Epileptik ensefalopatiler (EE), beyin gelişimi ve işlevi sürecinde ortaya çıkan epileptiform aktivitenin nöbetlere ve davranışsal, bilişsel ve motor yeteneklerde bozulmaya neden olduğu durumlardır. Erken başlangıçlı epileptik ensafalopatiler, yenidoğan döneminden geç çocukluk çağına kadar herhangi bir zamanda ortaya çıkarlar. Erken başlangıçlı EE’de, genetik nedenlerin önemli yer tuttuğu bilinmekte ve giderek artan sayıda sorumlu genler tanımlanmaktadır. EE’de moleküler tanı; uygun tedavi seçimi, doğru prognoz öngörüsü ve uygun genetik danışma verilmesi için önemlidir. Ancak ileri moleküler analize rağmen olguların ancak %50’sinde genetik etiyoloji belirlenebilmektedir. Bu projede soyağacında otozomal resesif kalıtım modeli gösteren ve daha önce moleküler tanı konulamamış olgularda tüm ekzom dizi analizi (TED) yapılarak epileptik ensefalopatiden sorumlu yeni genlerin bulunması hedeflenmiştir. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Nöroloji ve Çocuk Genetik Hastalıkları Bilim Dalları tarafından takip edilen, daha önce EE’den sorumlu 16 gen içeren bir yeni nesil dizi analizi paneliyle değerlendirilmiş olup moleküler tanısı konulamayan ve aile ağaçları ile otozomal resesif kalıtım düşünülen 3 aile çalışmaya dahil edilmiştir. Üç aileden 7 olguya tüm ekzom analizi (TED) yapılmış olup, analiz sonucunda belirlenen varyantların doğrulaması ve segregasyon analizi Sanger dizi analiziyle yapılmıştır. Tüm ekzom ekzom dizi analizi sonucunda üç ailede (Aile 1, Aile 2 ve Aile 3) sırasıyla DENND5A, GRN ve TBCD genlerinde hastalık yapıcı mutasyonlar bulunmuştur. Sonuç olarak, bu çalışmada epilepsi ile ilişkili nadir sendromlar belirlenerek genotip-fenotip ilişkisine katkıda bulunulmuştur. Aile ağacı otozomal resesif kalıtım düşündüren EE olgularında WES analizinin hedeflenmiş panele göre daha uygun bir tanı yöntemi olacağı düşünülmüştür.