Türkiyede koyun ve keçilerden toplanmış kenelerdeki mikrobiyota profilinin yeni nesil dizileme ile belirlenmesi ve olası patojen ilişkilerinin araştırılması
Proje no. 23606 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2022
Özet
Türkiye de dahil olmak üzere tüm dünyada kene kaynaklı hastalıkların önemi artmaktadır. Küresel ısınma, çevresel ve ekolojik değişiklikler ve uygun habitatların varlığı kenelerin etkinliğini arttırmakla birlikte bu durum zoonotik karakterli kene kaynaklı hastalıkların ortaya çıkma olasılığını da yükseltmektedir. Türkiye’de de insanlara ve hayvanlara keneler tarafından bulaştırılan toplam 19 hastalık bildirilmiştir. Diğer yandan vücudun çeşitli kısımlarında bulunan mikrobiyota dengesindeki değişikliklerin bu tür hastalıklara yatkınlık veya direnci arttırdığı veya azalttığı bilinmektedir. Buradan yola çıkarak bu projede, çiftlik hayvanlarından koyun ve keçilerden toplanan kenelerdeki mikrobiyota profili ve mikrobiyotanın keneler tarafından bulaştırılan protozoon hastalıkları arasında olan theileriosis etkeni Theileria spp. Ve babesiosis etkeni Babesia spp. ile potansiyel ilişkisinin moleküler yöntemler ile araştırılması amaçlanmıştır [koyunlardan toplanan (n=25), keçilerden toplanan (n=10)]. Bu amaç için ilk olarak kenelerden izole edilecek DNA örnekleri kenenin toplandığı organizma, yukarıda belirtilen protozoaların varlığı, ve tespit edilen kene türüne göre gruplandırılacaktır. Daha sonra izole edilen DNA örneklerinden 16S metagenomik analizi yapılıp örneklerdeki mikrobiyom profili belirlenecektir.<br /> Sonuç olarak proje sonunda;<br /> <br /> - Koyun ve keçilerden toplanan kenelerin mikrobiyota profilleri belirlenecektir.<br /> - Farklı kene türlerinde bulunan mikrobiyota profilleri belirlenecektir.<br /> - Kene mikrobiyotası ile anılan protozoaların varlığı/yokluğu arasındaki potansiyel ilişki ortaya çıkarılacaktır.<br /> <br /> Böylece, kenelerin bu hastalık etkenleri açısından vektörlükleri, ve kene mikrobiyotasının muhtemel manipülasyonunun bu hastalıklarla biyolojik mücadele kapsamında kullanılabilirliği hakkında bilgi edinilecektir.<br />