MAYA MANTARLARININ HIZLI TANIMLANMASINDA LİZİS FİLTRASYON SONRASI MALDITOF-MS YÖNTEMİNİN KULLANIMI
Proje no. 103 · Durum: Kapanmış · 2017
Özet
AMAÇ: Mantar enfeksiyonları özellikle immun yetmezliklerde ve diğer altta yatan hastalığı olanlarda giderek artmaktadır. Dünyada her yıl yüz binlerce insan yüksek mortalite ve morbiditesi nedeniyle invazif kandidozdan ciddi bir şekilde etkilenmektedir. Bu nedenle mantar enfeksiyonlarında erken tanı çok önemlidir ve mortalite oranını düşürmek için kısa sürede ve güvenilir sonuç veren yöntemlere ihtiyaç duyulmaktadır. Bu çalışmada, Candida türlerinin daha hızlı tanımlanabilmesi için lizis filtrasyon sonrası MALDI TOF MS (LF-MS) yönteminin uygunluğu araştırılmıştır. GEREÇ VE YÖNTEM: Bu çalışmada, Haziran 2017-Kasım 2018 tarihleri arasında Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na gönderilen pozitif kan kültürlerinden izole edilen 100 Candida suşu, Dalmau plak, MALDI TOF yöntemi ve LF- MS yöntemi ile çalışılmıştır. Lizis filtrasyon sonrası MALDI TOF MS tanımlama sonuçları, klasik MALDI TOF MS yönteminden elde edilen sonuçlarla karşılaştırılmış ve istatistikler, SPSS v. 25.0 kullanılarak, Cohen’in Kappa katsayısı analizi ile gerçekleştirilmiştir. BULGULAR: Çalışmamızda incelediğimiz 100 adet Candida türü konvansiyonel ve MALDI TOF tanımlama yöntemlerine göre; 37 C. albicans, 23 C. parapsilosis, 17 C. tropicalis, dokuz C. glabrata, altı C. kefyr, üç C. guilliermondii, üç C. dubliniensis, iki C. krusei olarak identifiye edilmiştir. Lizis filtrasyon sonrası MALDI TOF MS yönteminde ise identifikasyon sonuçları; 26 C. albicans, dokuz C. parapsilosis, 13 C. tropicalis, dokuz C. glabrata, iki C. kefyr, üç C. dubliniensis, iki C. krusei olarak belirlenmiştir. MALDİ-TOF yöntemi ve Dalmau plak ile LF- MS yöntemi 64 kökende uyumlu bulunmuştur. Uyumsuzluğun, yanlış identifikasyon nedeniyle değil, spektrum yetersizliği nedeniyle olduğu gözlenmiştir. SONUÇ: “Spektrum yetersizliği” olarak tanımlama dışı kalan suşlar, aslında veri tabanında yer alan türlerden oluşmaktadır. Altmış dört Candida türünün standart yöntemlerle %100 uyumlu olacak şekilde tanımlama yaptığı ve bu yöntemin subkültür gerektiren MALDI-TOF MS yöntemine göre en az 48 saat, Dalmau plak yöntemine göre de en az 72 saat avantaj sağladığı görülmüştür. Anahtar kelimeler: Matrix-yardımlı Laser Desorpsiyon-Ionizasyon Kütle Spektrometrisi; Filtrasyon; Candida spp; Kandidemi