Glioblastoma İntegrinlerini Yüksek Afinite ile Hedefleyecek Disintegrin Moleküllerinin Tasarımı Karakterizasyonu ve Silika Bazlı Nanotaşıyıcı Sistemlerine Entegrasyonu
Proje no. 21792 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2020
Özet
Sunulan proje kapsamında, grubumuz tarafından ülkemiz endemiği V. anatolica’a ait zehirden izole edilen biyoaktif RGD sekansı içeren disintegrin yapılarının amino asit sekansları incelenmiştir. Bu sekanslardan türetilecek elde edilen siklik pentapeptid yapıları ile yapılan moleküler docking ve moleküler dinamik çalışmalarında RGDDN, GRGDD gibi iki adet aspartik asidi yan yana içeren sekanslar ve bir doğal olmayan amino asit olan γ-karboksiglutamik asit (Gla) içeren sekansların alfa ve beta 3 disintegrininin bağlanma bölgesinden Mn 2+ iyonları ile etkileşimlerinin RGD sekansına göre daha iyi olabileceğini göstermiştir.<br /> Bu bilgiler ışığında yukarıda bashettiğimiz sekansları içeren yeni siklik pentapeptid sekansları tasarlanacaktır. Tasarlanmış bu yeni siklik peptidlerin integrinlerle olan etkileşimleri moleküler modelleme çalışmaları ile incelenecektir. Moleküler modelleme çalışmaları sonucunda en iyi skorlara ve etkileşimlere sahip olduğu gözlenen disintegrinlerden beş tanesi seçilerek katı fazda peptid sentezi yöntemi ile sentezlenecek ve ardından saflaştırılacaktır. Saflaştırılmış disintegrin moleküllerinin yapıları NMR ve LC-MS/MS ile belirlenip biyoaktivite tarama testine (hücre proliferasyonu-sitotoksisite testi) alınacaktır. Çalışmalar ekistatin disintegrini ile karşılaştırmalı olarak yürütülecektir. Bu amaçla, elde edilecek verilere göre en iyi aktiviteye sahip siklik peptid/peptidlerin daha yüksek miktarda sentezleri gerçekleştirilerek ileri biyolojik karakterizasyon testlerine alınacaktır (hücre adezyonu testi, flow sitometri ile integrin spesifitiesinin belirlenmesi ve western blot ile doğrulanması, anti-anjiyogenez etkisinin belirlenmesi). Çalışmanın son aşamasında biyolojik karakterizasyon testleri gerçekleştirlen polipetitlerin terapötik uygulamalar için önünü açabilmek adına açısından floresan boya katkılı mezorporlu silika nanoparçaçıklarla (MSN) yüklenerek nanotaşıyıcı sistemler yardımı ile özellikle beyine yönelik ilaç iletimlerinde engel oluşturan kan beyin bariyerini aşarak biyo-etkin maddelerin düşük mikartarlarda bile etkinliğini göstermesi sağlanacaktır. Proje ülkemizde bu alanda ilk çalışma olması bakımından özgündür.