Model membran sistemlerinin teorik, deneysel ve görüntü işleme teknikleri ile incelenmesi
Proje no. 23217 · Durum: Kapanmış (Yayın bekleniyor) · 2022
Özet
Yapılarının karmaşık olması nedeniyle biyolojik membranlarla çalışmak oldukça güçtür. Bu sebeple biyolojik membranlarla çalışmaya alternatif olarak, onlarla hemen hemen aynı özelliklere sahip, bileşen sayısı ve konsantrasyonu kontrol edilebilen model membranlar sıkça kullanılmaktadır. Böylece ajanların membranlar üzerindeki etkileri daha kolay anlaşılabilmektedir. Model membranlar ile ajanların moleküler düzeydeki etkileri ve etkileşimleri, birçok farklı teknikle laboratuvarda gerçekleştirilen deneyler yardımıyla belirlenebilmektedir. Ayrıca bu etkilerin ve etkileşimlerin teorik hesaplamaları, moleküler dinamik yazılımları yardımıyla gerçekleştirilebilmektedir. Bu iki yöntem dışında ise bilgisayar yazılımları aracılığıyla görüntü işleme tekniği kullanılarak model membran yapıları incelenebilmektedir. Fakat geçmişte bu yöntem ile gerçekleştirilen çalışmalar incelendiğinde, incelenen ve analiz edilen parametre sayısının (yoğunluk ölçümü, ebat ölçümü gibi) sınırlı sayıda kaldığı görülmektedir. Bu proje çalışmasında incelenecek parametre sayısı arttırılarak (farklı özelliklere sahip bölgelerin ayırt edilmesi, alanların hesaplanması, çap/yarıçap ölçümü, renk ve yoğunluk ölçümü, kavisliliğin belirlenmesi, yay uzunluğunun hesaplanması gibi), model membran yapılarındaki görsel oluşumların daha etkili şekilde yorumlanmasının sağlanması amaçlanmaktadır. İncelenecek bu görüntüler, birden fazla mikroskobik görüntüleme yönteminden yararlanılarak elde edilecektir. Bu sayede birden fazla ilacın, farklı farklı konsantrasyonlarda model membranlarla etkileşimi, farklı yöntemlerle görüntülenip analiz edilebilecektir.<br /> Bu proje çalışmasında, belirlediğimiz ajanların model membranlar üzerindeki etkileri, farklı konsantrasyonlara bağlı olarak deneysel, teorik ve görüntü işleme yöntemlerinin bir arada kullanılmasıyla incelenecektir. İncelemeler sonucunda, bu üç yöntem ile elde edilen verilerin yorumlanmasıyla, model membran sistemlerindeki olası etkilerin ve etkileşimlerin daha iyi anlaşılabilmesi adına önemli bilgilerin elde edilmesi beklenmektedir.