DOMATES TOHUM VE FİDE ÇOĞALTIM MATERYALİNDE BAKTERİYEL KANSER VE SOLGUNLUK ETMENİ CLAVİBACTER MİCHİGANENSİS SUBSP. MİCHİGANENSİSİN HIZLI VE GÜVENİLİR TANISI İÇİN YÖNTEM OPTİMİZASYONU
Proje no. 1109 · Durum: Kapanmış · 2017
Özet
Domates yetiştiriciliğindeki en önemli sorunlardan biri bakteriyel kanser ve solgunluk etmeni Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm) ‘dir. Etmenin tohum ve fide yoluyla taşınması, bitki içerisinde sistemik olarak ilerlemesi, fide döneminde belirti vermemesi nedeniyle tanısı oldukça güçtür. Hastalık belirtileri gözlenmeye başladığında ise etmenin sera ya da tarlada mücadelesi sistemik kolonizasyonu nedeniyle olanaksızdır. Bu nedenle, Cmm’nin tohum ve fide aşamasında kesin tanısı önem kazanmaktadır. Bu çalışmanın amacı, Tohum Teknolojisi Uygulama ve Araştırma Merkezi (TOTEM)’ne gönderilen tohum ve fide materyalinde klasik ve moleküler tanı yöntemlerini duyarlılık, hızlılık, güvenilirlik ve ekonomik açıdan karşılaştırmaktır. Proje kapsamında tanılama çalışmalarında genel ve yarı-selektif besiyerine ekim, fizyolojik ve biyokimyasal testler, patojenisite testleri ve moleküler yöntem olarak klasik PCR kullanılmıştır. Türe spesifik primerler kullanılarak yapılan PCR yönteminin kesin tanı açısından hızlı ve güvenilir bir yöntem olduğu saptanmıştır. Ancak, doğru bakteri kolonilerinin seçilmesinin de PCR sonucunu etkilediği değerlendirilmiştir. Bu nedenle, yarı selektif besiyerine ekim ve koloni gelişimini takiben, PCR’ın en ideal ve ekonomik yöntem olduğu sonucuna varılmıştır. Bu proje sonucunda, tohum ve fide materyalinde hastalık etmenlerini tanılayan merkez olan TOTEM için Cmm'in tanılamasının optimizasyonu gerçekleştirilmiştir