Evaluation of the Performance of a Multiplex PCR Method for the Diagnosis of Viral Respiratory Tract Infections
Makaleler > Tam Makale · 2016
Yazarlar: ayse ARSLAN, Candan ÇİÇEK, Eylem Ulaş SAZ, Figen GÜLEN, haydar KARAKUŞ SOYDANER
Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, Diğer Kurumların Hakemli Dergileri, Uluslararası, Scopus, 2016, cilt 46, ss 159-164
Özet
Viral Solunum Yolu Enfeksiyonlarının Tanısında Bir Multipleks PCR Yönteminin Performansının değerlendirilmesi § ÖZ Amaç: Çalışmada, akut solunum yolu enfeksiyonu olan hastalarda solunum virüslerinin saptanmasında konvansiyonel yöntemlerle ["shell vial" hücre kültürü yöntemi, direkt fluoresans antikor (DFA)] multipleks polimerize zincir tepkimesi (PCR) test yöntemini karşılaştırmak ve multipleks PCR testinin performansını değerlendirmek amaçlanmıştır.Gereç ve Yöntem: Bu çalışmada, Ocak 2012-Ağustos 2013 tarihleri arasında solunum yolu enfeksiyonu tanılı 502 [217 (%43.2) kadın, 285 (%56.8)erkek] nazofarengeyal sürüntü örneği incelendi.Solunum virüslerinin saptanmasında, DFA ve "shell vial" hücre kültürü yöntemi altın standart olarak alındı.Multipleks PCR testi için, üretici firmanın önerileri doğrultusunda çalışıldı.Bulgular: Değerlendirilen hastaların 238'inde (%47.4)en az bir yöntemle solunum virüsleri pozitif bulundu.İncelenen 502 örneğin 189'u (%37.6)DFA ve shell vial hücre kültürü yöntemi ile pozitif [human metapneumovirus (HMPV), human coronavirus (HCoV), human rhinovirus (HRV), human bocavirus (HBoV) ve parainfluenza virüs tip 4 (PIV 4) hariç], 233'ü (%46.4)multipleks PCR ile pozitif bulundu.Yalnızca HMPV, HCoV, HRV, HBoV ve PIV 4'ün pozitif olduğu 37 örnek, DFA ve shell vial hücre kültürü ile saptanamadığı için karşılaştırma dışı bırakıldı.Hücre kültürü ve DFA'ya göre multipleks PCR yönteminin duyarlılık, özgüllük, PPV, NPV ve test geçerlilik oranları sırasıyla %97.3, %95.7, %93.9, %98.1 ve %96.3 olarak bulundu.Sonuç: Solunum yolu enfeksiyonu olan hastalarda sırasıyla en sık saptanan solunum virüsleri respiratory sinsitial virüs (RSV), HRV ve influenza virüs tip A (INF A) olmuştur.Multipleks PCR'ın duyarlılık ve özgüllüğü oldukça yüksek bulunmuştur.Multipleks PCR'ın DFA ve hücre kültürü yöntemleriyle saptanamayan 37 solunum virüsünü de tanımlayabildiği görülmüştür.Multipleks PCR'ın yüksek duyarlılık ve özgüllüğe nedeniyle rutin laboratuvar kullanımına uygun olduğu öngörülmüştür.